◆ 搭乘高鐵：建議至左營站後轉搭台鐵至高雄火車站，轉乘國光客運、中南客運、高雄客運至墾丁或是東港的車次。
◆ 搭乘台鐵：請搭至高雄火車站，轉乘國光客運、中南客運、高雄客運至墾丁或是東港的車次。

◆ 客運搭乘處：從高雄搭乘(請搭乘國光客運、中南客運、高雄客運至墾丁或是東港的車次)
乘車處：
1.中南客運建國二路候車站(高雄火車站斜對面，近建國二路及中 山路交叉口)
2.高雄客運南華站(南華路上，高雄車站後方)
3.舊高雄火車站高市願景館對面
於東港輔英醫院站下車後，向碼頭方向步行約10分鐘就可抵達。
◆ 從屏東搭乘
乘車處：
屏東火車站旁屏東客運總站 搭乘「屏東←→東港」班車 (路線：屏東→公館→新園→烏龍→東港)車程約45至60分，抵達東港後再至東港碼頭(步行約10分鐘)，搭交通船到小琉球 。

◆ 自行開車(南下)：
A. 國道一號高速公路南下：由小港機場出口沿省道十七號公路，往東港 行駛即可抵達東港碼頭，再搭交通船到小琉球。
B. 國道三號高速公路南下：由林邊交流道下接台十七公路，往東港行駛即可抵達東港碼頭，再搭交通船到小琉球。
◆ 自行開車(北下)：
自墾丁沿26號省道至枋寮、水底寮，再沿17號省道至林邊、東港， 抵達東港後再至東港碼頭，搭交通船到小琉球。
自行開車前往者，汽車則須停靠於東港，機車及自行車可隨人運至小琉球。